Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms