Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLRP9Q7RTR0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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