Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms