Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD2Q16342 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms