Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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