Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms