Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms