Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL9Q07325 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms