Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSE1LP55060 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSE1LP55060 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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