Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms