Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ME1P48163 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ME1P48163 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms