Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMPOP42166 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMPOP42166 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMPOP42166 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMPOP42166 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMPOP42166 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMPOP42166 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMPOP42166 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms