Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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