Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRM2P31350 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RRM2P31350 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RRM2P31350 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RRM2P31350 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RRM2P31350 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms