Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NELFEP18615 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms