Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XBP1P17861 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XBP1P17861 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms