Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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