Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SMIM1B2RUZ4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms