Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms