Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms