Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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