Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms