Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms