Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms