Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD8Q96LT4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms