Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms