Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-CQ95604 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-CQ95604 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms