Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms