Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DTX3LQ8TDB6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms