Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms