Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms