Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms