Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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