Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms