Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP6Q16828 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms