Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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RPE65Q16518 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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