Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms