Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms