Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms