Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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