Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D3P61077 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D3P61077 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D3P61077 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D3P61077 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D3P61077 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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