Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms