Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms