Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6V1E1P36543 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6V1E1P36543 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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