Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP5F1P24539 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP5F1P24539 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms