Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI1P08151 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GLI1P08151 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms