Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
THY1P04216 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
THY1P04216 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
THY1P04216 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms