Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms