Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms