Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C19orf12Q9NSK7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms